OpenAIが数千のエージェントをマウス脳アトラスに投入。32分で仮説は出たが、確かめるのは実験室だ

OpenAI、PerturbAI、Scripps Researchは、GPT-Rosalindで動く数千のエージェントに、数百万個のマウス脳細胞から得られた既存データを解析させた。32分で仮説のマップができあがった。チームの見積もりでは、人間なら数か月から1年かかる作業だという。注目すべきは作業の分け方だ。新しい手がかりは、まだどの実験室でも確認されていない。

エージェント一体ごとに遺伝子撹乱を一つ割り当て、文献をたどらせた

データの出どころは全脳CRISPRアトラスで、個々の遺伝子を壊すとマウス脳のさまざまな細胞がどう変わるかを示している。チームは各エージェントに遺伝子撹乱を一つずつ割り当てた。エージェントは細胞の反応を調べ、論文を検索し、説明を提案する。個別のレポートはreasoning atlasにまとめられ、遺伝子、細胞への影響、文献、考えられる生物学的メカニズムが結びつけられた。OpenAIはこの手法をdistributed biological reasoningと呼ぶ。

OpenAIによると、エージェントは人間が以前に出した結論を再現したうえで、新たな手がかりも加えた。一つはmTOR経路を共同で制御するTsc1とTsc2に関するものだ。小脳ではTsc2を壊すと神経細胞間の情報伝達に関わる数十の遺伝子の活動が変わったが、Tsc1ではほとんど変化がなかった。もう一つはDCTN1で、その変異はパーキンソン病に似た症状を示すペリー症候群の原因となる。DCTN1を壊すとコレステロール合成遺伝子の活動が高まった。エージェントはここから、コレステロール輸送の異常が神経変性に関わるのではないかという問いを導いた。

研究は10月16日にbioRxivでプレプリントとして公開され、査読はまだ受けていない。著者のうち6人がOpenAI、2人がPerturbAIの社員だ。reasoning atlasはGitHubで、データセットはHugging Faceで公開されている。

大勢のエージェントは、過負荷の一体より多くの文献を読む

論文で最も示唆に富む比較は、一体のエージェントと数千体の対決だ。チームは同じモデルに同じリソースでデータセット全体を一度に渡した。仕事量が増えるほど、文献検索は減った。最大の負荷では引用は11件にとどまり、分散エージェントは700件を超えた。盲検比較では、専門家は75 %の割合で分散エージェントのレポートを選んだ。

大規模なスクリーニングデータを抱える研究室にとって、これは実用的な教訓だ。巨大な指示を受けた単体のエージェントは手を抜き始める。小さく絞ったタスクなら並列に走らせ、後で結果をまとめられる。開発チームはサブエージェントで同じパターンを知っている。データが読む人の数より速く増える分野なら、どこにでも広がりそうだ。

ビジネス面の文脈もある。OpenAIはここ数週間、Rosalindシリーズを中心に事業を固めてきた。選抜制の学術プログラムと、スタートアップOrchestra Bioの買収だ。脳アトラスの研究は、このモデルが実際に何のためにあるのかを示す見本になっている。

32分の比較相手は見積もりで、実在の人間チームではない

数字には文脈が要る。「数か月から1年」は、撹乱を一つずつ人間が分析した場合のチームによる見積もりだ。エージェントと並行して作業した人間のチームはいない。75 %という選好は同じモデルの二つの構成を比べたもので、モデルと科学者の比較ではない。専門家の評価と一致したことは、仮説がもっともらしく新しく見えることを示すだけだ。正しいことを示すわけではない。

発表は、数千のエージェントを並列に動かすのにどれだけの計算資源を使ったかも明かしていない。しかもGPT-Rosalindは一般公開されたモデルではなく、OpenAIは選ばれた組織と研究室にしか使わせていない。自分のデータで同じ手法を試したい人には、今のところ招待が必要だ。

決め手は神経細胞のコレステロール実験になる

この手法を裏づけるのも葬るのも、具体的な仮説を一つ取り上げて検証する最初の実験室だ。最有力の候補はDCTN1の手がかりだろう。神経細胞内のコレステロール分布が本当に変わるなら、エージェントが作ったマップは初めて確かな裏づけを得る。

二つ目のシグナルは査読と、OpenAIと関係のないグループがこの手法を採用するかどうかだ。公開されたアトラスとデータがそれを可能にする。閉じたモデルのほうは、今のところそうはいかない。

Lilithの判定

数千のエージェントが30分で、マウスの脳について700件を超える引用と怪しい遺伝子のリストを集めた。ここからはピペットを握るポスドクの出番だ。神経細胞の中でコレステロールが本当に迷子になっているのか、それともエージェントが論文で読んだだけなのかを確かめなければならない。